More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4861 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4861  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
330 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.250343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  71.75 
 
 
279 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  66.02 
 
 
253 aa  381  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  62.58 
 
 
253 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  59.8 
 
 
284 aa  337  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  60.97 
 
 
261 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4762  dimethyladenosine transferase  62.9 
 
 
253 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  56.49 
 
 
269 aa  335  5.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  58.71 
 
 
268 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  61.11 
 
 
255 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  47.8 
 
 
278 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  47 
 
 
275 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  46.18 
 
 
278 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  44.97 
 
 
273 aa  242  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  44.97 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  44.97 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  44.97 
 
 
273 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  44.97 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  44.97 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  44.97 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  44.97 
 
 
273 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  45.28 
 
 
277 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  44.97 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  44.2 
 
 
276 aa  238  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  46.03 
 
 
281 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  43.59 
 
 
272 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  46.01 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  43.08 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  42.45 
 
 
273 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  43.85 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  43.08 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  43.85 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  43.08 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  43.85 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  43.85 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  46.5 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  42.72 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  43.85 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  43.85 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  46.35 
 
 
276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  43.59 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  43.85 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  46.5 
 
 
275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  45.89 
 
 
273 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  43.27 
 
 
272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  46.5 
 
 
275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  46.5 
 
 
275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  44.98 
 
 
276 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  42.14 
 
 
273 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  46.96 
 
 
281 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0204  dimethyladenosine transferase  72.19 
 
 
256 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.919741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  43.49 
 
 
272 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  44.27 
 
 
272 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  40.95 
 
 
281 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  45.22 
 
 
255 aa  225  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  42.31 
 
 
255 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  42.99 
 
 
273 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  43.71 
 
 
267 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  43.04 
 
 
259 aa  219  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  42.22 
 
 
272 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  42.22 
 
 
272 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  42.22 
 
 
272 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  44.01 
 
 
265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  42.26 
 
 
268 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  40.49 
 
 
285 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  41.94 
 
 
268 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  41.94 
 
 
268 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  41.61 
 
 
268 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  37.91 
 
 
301 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  41.8 
 
 
268 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  41.8 
 
 
268 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  45.02 
 
 
255 aa  207  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  40.97 
 
 
269 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1571  dimethyladenosine transferase  41.16 
 
 
264 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.836645  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  41.48 
 
 
268 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  41.48 
 
 
268 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  43.51 
 
 
274 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
267 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03414  dimethyladenosine transferase  40.8 
 
 
252 aa  205  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  39.81 
 
 
270 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  40.13 
 
 
272 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  41.27 
 
 
268 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  40.84 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  41.29 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  40.65 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  41.27 
 
 
268 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  39.81 
 
 
266 aa  199  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  41.35 
 
 
269 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  39.81 
 
 
267 aa  198  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 
268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  41.03 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  38.68 
 
 
269 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  39.49 
 
 
282 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  40.13 
 
 
267 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  39.2 
 
 
271 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 
267 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 
256 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  38.36 
 
 
269 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1867  dimethyladenosine transferase  40.78 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>