More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1867 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1867  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1571  dimethyladenosine transferase  83.72 
 
 		 264 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.836645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  49.22 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  51.71 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  51.71 
 
 		 275 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  51.71 
 
 		 275 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  51.71 
 
 		 275 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  51.71 
 
 		 275 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  52.51 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  51.33 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  51.74 
 
 		 281 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  50.95 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  52.51 
 
 		 281 aa  238  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  50 
 
 		 278 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  50.19 
 
 		 275 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  50.19 
 
 		 275 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  51.97 
 
 		 276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  51.18 
 
 		 275 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  48.05 
 
 		 272 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  48.82 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  48.62 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  48.43 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  47.94 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  48.62 
 
 		 261 aa  221  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  45.74 
 
 		 284 aa  218  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  48.21 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  47.49 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  47.49 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  47.49 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  47.49 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  47.49 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  47.49 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  47.79 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  47.49 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  47.1 
 
 		 273 aa  215  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  47.1 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  44.79 
 
 		 256 aa  214  8e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  44.79 
 
 		 256 aa  214  8e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4762  dimethyladenosine transferase  47.64 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  45.21 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0204  dimethyladenosine transferase  48.4 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.919741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  45.77 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  47.27 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  46.33 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  46.48 
 
 		 272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  43.08 
 
 		 301 aa  211  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  48.63 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  44.02 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  46.48 
 
 		 272 aa  210  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  45.77 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  50.22 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  45.56 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  45.95 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  45.77 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  45.95 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  45.95 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  45.95 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  45.95 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  45.95 
 
 		 268 aa  208  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  49.78 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  45.17 
 
 		 273 aa  208  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  49.33 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  45.42 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  45.7 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  44.62 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  45.77 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  49.33 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  45.38 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  45.21 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  46.88 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  43.24 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  44.84 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  46.56 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  48.1 
 
 		 272 aa  205  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  44.62 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  46.09 
 
 		 272 aa  205  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  46.09 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  46.09 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  45.59 
 
 		 268 aa  204  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  42.38 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  43.85 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  43.68 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  43.75 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  44.53 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  41.11 
 
 		 277 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  44.92 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  43.75 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  41.41 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4861  dimethyladenosine transferase  40.78 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.250343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  43.36 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>