More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0062 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 302 aa  622  1e-177  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  67 
 
 		 307 aa  404  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  56.16 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  54.55 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  53.19 
 
 		 316 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  52.33 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  54.26 
 
 		 284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  53.55 
 
 		 302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  52.1 
 
 		 288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  53.09 
 
 		 289 aa  266  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  50.72 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  50.52 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  51.19 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  51.24 
 
 		 293 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  52.43 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  52.73 
 
 		 289 aa  251  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  51.06 
 
 		 295 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05390  dimethyladenosine transferase  52.33 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0963646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1283  dimethyladenosine transferase  52.45 
 
 		 290 aa  248  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000558155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3232  dimethyladenosine transferase  50.17 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1952  dimethyladenosine transferase  51.6 
 
 		 600 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  47.7 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  45.67 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  45.17 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  51.59 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2725  dimethyladenosine transferase  53.09 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  53.87 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  47.33 
 
 		 290 aa  234  9e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  45.67 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  45.67 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  50.53 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  45.33 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  49.15 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0767  dimethyladenosine transferase  48.24 
 
 		 291 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0854  dimethyladenosine transferase  44.98 
 
 		 319 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0906  dimethyladenosine transferase  49.48 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00888376  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3964  dimethyladenosine transferase  48.73 
 
 		 251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  37.32 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  37.98 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.09 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  36.49 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  35.93 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  37.91 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  35.31 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  32.63 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 		 292 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  34.28 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  36.9 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  37.54 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  36.77 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  32.66 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  33.95 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  34.81 
 
 		 275 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  35.34 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  35.56 
 
 		 275 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  32.98 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  32.98 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  35.91 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  34.7 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  35.09 
 
 		 267 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  35.16 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  34.48 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  32.58 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 271 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  34.02 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  34.65 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  32.95 
 
 		 264 aa  146  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  34.25 
 
 		 272 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  34.8 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.962879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>