More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6125 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 		 263 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  51.42 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  49.09 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  47.64 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  40.87 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  41.18 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.7 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4045  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.92 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344042  normal  0.123945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  29.57 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  37.25 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.27 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.63 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  28.63 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1220  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  29.63 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00652696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1343  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  29.63 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2510  rRNA adenine N-6-methyltransferase  29.63 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1713  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  29.63 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  29.63 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1747  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  29.63 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0257214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  29.63 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  25.48 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  32.83 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28640  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  35.07 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1812  dimethyladenosine transferase  24.41 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  25.66 
 
 		 296 aa  92  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0508  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  39.32 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  24.62 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0004  dimethyladenosine transferase  22.9 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.50922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  29.12 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  25.65 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  26.05 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  26.09 
 
 		 263 aa  88.6  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  34.02 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  31.82 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  31.43 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  32.45 
 
 		 293 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  30.2 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  28.02 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  25.65 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  26.52 
 
 		 298 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  30.77 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  26.54 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  28.78 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  31.9 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  34.36 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1923  ribosomal RNA adenine methylase transferase  41.78 
 
 		 196 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.869968  normal  0.0208059 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1104  dimethyladenosine transferase  33.5 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  28.1 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  34.24 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  27 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  27 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1382  dimethyladenosine transferase  32.82 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.462909  normal  0.033279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  27.49 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  29.95 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0404  dimethyladenosine transferase  31.66 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.651839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  25.93 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  31.87 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2090  dimethyladenosine transferase  23.4 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  27.27 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  29.72 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  22.74 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  25.9 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  26.59 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  29.76 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  31.32 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  30.73 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  28.34 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  27.86 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  33.67 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  28.36 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  28.06 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  25.48 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  28.12 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  30.56 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  28.79 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  27.4 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  26.75 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  27.17 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  32.99 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1746  dimethyladenosine transferase  26.36 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  24.12 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  31.32 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  30.77 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  29.92 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  27.13 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>