More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0550 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0550  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
262 aa  526  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.659691  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1871  dimethyladenosine transferase  63.78 
 
 
254 aa  324  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  57.65 
 
 
256 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1958  dimethyladenosine transferase  58.43 
 
 
257 aa  289  4e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.331165  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  54.76 
 
 
258 aa  281  9e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2392  dimethyladenosine transferase  46.5 
 
 
284 aa  195  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  41.04 
 
 
270 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0621  dimethyladenosine transferase  44.31 
 
 
292 aa  180  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  44.17 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2671  dimethyladenosine transferase  43.4 
 
 
290 aa  176  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2104  dimethyladenosine transferase  41.95 
 
 
303 aa  171  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.097834  normal  0.0562097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  40.8 
 
 
287 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
267 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
267 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 
266 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  43.52 
 
 
269 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  38.93 
 
 
266 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  40.64 
 
 
249 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 
268 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 
268 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 
268 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 
268 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 
271 aa  149  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  41.05 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  40.31 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 
272 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  40.48 
 
 
263 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  40.48 
 
 
263 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  41.78 
 
 
320 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  42.47 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  40.16 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  39.15 
 
 
274 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19122  predicted protein  35.66 
 
 
322 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  41.12 
 
 
297 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  41.12 
 
 
297 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  34.22 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  38.24 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  39.45 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  34.08 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  34.08 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00110  rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase, putative  39.52 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0222331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
284 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 
266 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  34.08 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  33.72 
 
 
258 aa  132  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 
288 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  37.27 
 
 
276 aa  131  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  36.54 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  33.72 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
275 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
275 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
275 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  33.08 
 
 
268 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
275 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
275 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  40.81 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  37.12 
 
 
277 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
281 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  34.3 
 
 
301 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  34.48 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  40.18 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  32.36 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  39.7 
 
 
297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  39.09 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  39.17 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  33.71 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  39.91 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  40.55 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  38.57 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 
284 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>