More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00110 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00110  rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase, putative  100 
 
 
325 aa  663    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0222331  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75487  Dimethyladenosine transferase (S-adenosylmethionine-6-N', N'-adenosyl(rRNA) dimethyltransferase) (18S rRNA dimethylase)  61.49 
 
 
323 aa  385  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.368235 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  58.36 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19122  predicted protein  50.93 
 
 
322 aa  295  6e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03313  dimethyladenosine transferase (AFU_orthologue; AFUA_7G04860)  56 
 
 
403 aa  293  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.816123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  39.9 
 
 
287 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  42.37 
 
 
270 aa  145  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  37.33 
 
 
249 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  40.11 
 
 
243 aa  143  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1958  dimethyladenosine transferase  38.99 
 
 
257 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.331165  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 
256 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  34.02 
 
 
263 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  39.64 
 
 
281 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  32.95 
 
 
269 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  36.25 
 
 
261 aa  136  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0550  dimethyladenosine transferase  39.52 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.659691  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 
271 aa  134  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2392  dimethyladenosine transferase  42.71 
 
 
284 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  34.92 
 
 
263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  34.45 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  36.11 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 
272 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2671  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  32.93 
 
 
272 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  36.44 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  37.62 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 
266 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  32.53 
 
 
272 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  33.99 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0621  dimethyladenosine transferase  35.83 
 
 
292 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  34.09 
 
 
267 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  32.66 
 
 
268 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  38.03 
 
 
266 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  32.66 
 
 
268 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 
276 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1871  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 
254 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 
281 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 
267 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 
262 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  33.81 
 
 
277 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  34.84 
 
 
275 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 
260 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  41.23 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  32.89 
 
 
267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  33.91 
 
 
268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 
297 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 
269 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  29.93 
 
 
314 aa  119  9e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  32.31 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  32.31 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  33.91 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  35.16 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  37.1 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1104  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 
230 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  32.32 
 
 
264 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  32.73 
 
 
272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0404  dimethyladenosine transferase  35.02 
 
 
235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.651839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  33.78 
 
 
281 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  34.27 
 
 
267 aa  116  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  31.65 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  34.76 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  33.19 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  34.1 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  34.48 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  36.25 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2104  dimethyladenosine transferase  35.32 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.097834  normal  0.0562097 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  32.2 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  36 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  32.7 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  31.96 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 
276 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  33.03 
 
 
257 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  32.26 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  31.51 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  34.56 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  30.54 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  34.92 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  27.45 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  34.8 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  31.67 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  32.92 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  33.19 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  32.89 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  33.04 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  29.21 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  33.94 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  35.91 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
278 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 
267 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 
275 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  30.6 
 
 
274 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>