More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1958 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1958  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 257 aa  508  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.331165  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1871  dimethyladenosine transferase  59.13 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0550  dimethyladenosine transferase  58.43 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.659691  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  57.81 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  55.86 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  41.77 
 
 		 270 aa  190  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  43.75 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2392  dimethyladenosine transferase  44.35 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2104  dimethyladenosine transferase  43.61 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.097834  normal  0.0562097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  43.2 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2671  dimethyladenosine transferase  45.71 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0621  dimethyladenosine transferase  42.97 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  41.43 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  43.69 
 
 		 243 aa  158  9e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  41.9 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  42.38 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  39 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  38.61 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  45.19 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  38.61 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19122  predicted protein  38.46 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  39.52 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  35.5 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00110  rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase, putative  38.99 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0222331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  39 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  42.59 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  37.16 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.07 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  36.12 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  36.68 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75487  Dimethyladenosine transferase (S-adenosylmethionine-6-N', N'-adenosyl(rRNA) dimethyltransferase) (18S rRNA dimethylase)  38.31 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.368235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  33.72 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  34.23 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  33.2 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  32.95 
 
 		 268 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  32.95 
 
 		 268 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  37.9 
 
 		 276 aa  131  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03313  dimethyladenosine transferase (AFU_orthologue; AFUA_7G04860)  37.21 
 
 		 403 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.816123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  32.95 
 
 		 268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  32.95 
 
 		 268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  35.91 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 		 281 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  33.98 
 
 		 268 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 268 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  39.34 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  32.95 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  32.95 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  34.87 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  33.72 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  37.87 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 		 290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  33.98 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  32.02 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  33.84 
 
 		 282 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  33.98 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  36.54 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  35.48 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  34.98 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  32.32 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>