More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19122 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_19122  predicted protein  100 
 
 
322 aa  664    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  57.39 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00110  rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase, putative  50.93 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0222331  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75487  Dimethyladenosine transferase (S-adenosylmethionine-6-N', N'-adenosyl(rRNA) dimethyltransferase) (18S rRNA dimethylase)  51.38 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.368235 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03313  dimethyladenosine transferase (AFU_orthologue; AFUA_7G04860)  49.12 
 
 
403 aa  259  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.816123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
287 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1958  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 
257 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.331165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  35.86 
 
 
270 aa  143  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 
258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0550  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
262 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.659691  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  39.09 
 
 
271 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  37.44 
 
 
279 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  35.84 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  34.01 
 
 
249 aa  133  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
243 aa  133  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  33.68 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  37.82 
 
 
227 aa  130  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2392  dimethyladenosine transferase  37.66 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  34.26 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1871  dimethyladenosine transferase  34.68 
 
 
254 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 
264 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  31.2 
 
 
263 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  36.32 
 
 
263 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  34.8 
 
 
305 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  36.28 
 
 
261 aa  123  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  33.76 
 
 
316 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  32.3 
 
 
267 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 
266 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  35.35 
 
 
263 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  33.47 
 
 
272 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
281 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  33.62 
 
 
263 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  31.69 
 
 
267 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1382  dimethyladenosine transferase  34.18 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.462909  normal  0.033279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  36.89 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0621  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2671  dimethyladenosine transferase  33.93 
 
 
290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  32.13 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  33.62 
 
 
272 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
292 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
292 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
292 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
292 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  33.19 
 
 
272 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
292 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
292 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  34.1 
 
 
272 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
292 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  34.08 
 
 
274 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  30.88 
 
 
275 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  34.1 
 
 
266 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  33.75 
 
 
284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  29.63 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  34.23 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  33.63 
 
 
299 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 
297 aa  116  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 
267 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  33.48 
 
 
257 aa  116  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  35.4 
 
 
281 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  34.23 
 
 
268 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  33.63 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  30.25 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 
267 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  33.18 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  34.67 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  33.18 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  35.22 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  34.25 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  33.03 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  33.05 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  32 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1104  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  34.06 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  32.41 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  30.46 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  29.62 
 
 
287 aa  113  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  32.44 
 
 
272 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  30.41 
 
 
255 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  32.89 
 
 
285 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  32.77 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  31.51 
 
 
301 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  33.8 
 
 
292 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  30.98 
 
 
266 aa  112  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  35.65 
 
 
276 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  28.82 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  33.94 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>