More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1104 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1104  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 230 aa  454  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0404  dimethyladenosine transferase  77.43 
 
 		 235 aa  364  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.651839 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  77.68 
 
 		 227 aa  357  7e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1382  dimethyladenosine transferase  76.44 
 
 		 228 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.462909  normal  0.033279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  38.74 
 
 		 259 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2392  dimethyladenosine transferase  43.06 
 
 		 284 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  39.63 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0492  ribosomal RNA adenine methylase transferase  42.93 
 
 		 270 aa  138  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  43.52 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  42.59 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  43.65 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 		 264 aa  134  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  39.64 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  39.83 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1867  dimethyladenosine transferase  39.32 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1571  dimethyladenosine transferase  37.86 
 
 		 264 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.836645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1871  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  39.01 
 
 		 297 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  39.01 
 
 		 297 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  39.01 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 267 aa  131  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 263 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  39.07 
 
 		 275 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  40.37 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  38.03 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 		 268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2671  dimethyladenosine transferase  40.58 
 
 		 290 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  39.63 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  40.67 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  39.35 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  39.09 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  38.03 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  46.38 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  38.14 
 
 		 281 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  37.9 
 
 		 262 aa  128  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  38.03 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  37.34 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  35.97 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  37.39 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  39.81 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  40.09 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 		 285 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  38.56 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  39.81 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  38.61 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 		 302 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  39.04 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  37.33 
 
 		 287 aa  124  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 		 292 aa  124  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 		 253 aa  124  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  40.09 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  37.33 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0204  dimethyladenosine transferase  42.13 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.919741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  39.91 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  35.37 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  34.11 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  36.14 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  36.48 
 
 		 268 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  41.44 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  38.92 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  37.33 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 		 273 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  37.75 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4762  dimethyladenosine transferase  38.32 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  40.18 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>