More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0492 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0492  ribosomal RNA adenine methylase transferase  100 
 
 		 270 aa  534  1e-151  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0404  dimethyladenosine transferase  45.45 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.651839 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1382  dimethyladenosine transferase  42.64 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.462909  normal  0.033279 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1104  dimethyladenosine transferase  42.93 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  39.52 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  31.72 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  36.49 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  40.44 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1334  ribosomal RNA adenine methylase transferase  37.1 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0549098  normal  0.233187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  37.33 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  36.87 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  36.99 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  34.87 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  38.57 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  41.62 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  35.68 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  38.57 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  35.9 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  33.72 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  34.26 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  36.02 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  38.25 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  36.46 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  36.46 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  36.46 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  33.84 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  32.82 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  32.82 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  33.84 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  37.33 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4762  dimethyladenosine transferase  35.1 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  34.76 
 
 		 269 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  33.94 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  33.98 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  32.95 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  37.63 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  34.75 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  33.65 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  37.43 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  33.65 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  38.14 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  36.9 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  36.9 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  33.97 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  33.97 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  33.97 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  39.8 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  33.21 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  29.18 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  32.58 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  31.52 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  33.98 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  29.23 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  29.96 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  30.12 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  31.94 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0204  dimethyladenosine transferase  33.82 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.919741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  31.91 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  31.54 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  34.13 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  31.37 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  34.76 
 
 		 273 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 272 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  31.87 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  34.76 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>