More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28640  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  100 
 
 		 269 aa  520  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  31.54 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.07 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.93 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  31.95 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  37.85 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  31.87 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  36.11 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  28.79 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  28.35 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  28.36 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  30.85 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  31.44 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0278  dimethyladenosine transferase  32.07 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.525697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12019  methyltransferase  43.87 
 
 		 179 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  34.62 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  30.8 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  29.74 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1220  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  27.96 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00652696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1343  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  27.96 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2510  rRNA adenine N-6-methyltransferase  27.96 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1747  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.96 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0257214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1713  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.96 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.96 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.96 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09471  dimethyladenosine transferase  30.81 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0967055 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  29.04 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3509  dimethyladenosine transferase  29.15 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.627575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.43 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  27.88 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1923  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.95 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.869968  normal  0.0208059 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  31.98 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  33.67 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  28.73 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  31.25 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  29.55 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  29.21 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  30.05 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  26.91 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  29.15 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  29.15 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  29.81 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  31.6 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  27.57 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  31.87 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2671  dimethyladenosine transferase  31.28 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.51 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  29.05 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  26.79 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.86 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  30.77 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.48 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  30.91 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  30.91 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  25.68 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  29.17 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  28.36 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  29.12 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  23.72 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  28.86 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  25.69 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  29.2 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  31.11 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  28.33 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  28.42 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  27.55 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  27.51 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  27.87 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  29.35 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  27.55 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  30.15 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10161  dimethyladenosine transferase  23.35 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  28.57 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  29.19 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  28.36 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09271  dimethyladenosine transferase  32.43 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  30.42 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  30.83 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  29.41 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09251  dimethyladenosine transferase  31.53 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  25.29 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  31.05 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0866  dimethyladenosine transferase  31.53 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  29.94 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  27.76 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  29.58 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  29.95 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  26.49 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  25.94 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>