More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  100 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  53.98 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  54.67 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  49.09 
 
 		 263 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  38.8 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  38.92 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  37.36 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  38.38 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  38.99 
 
 		 295 aa  95.9  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.93 
 
 		 275 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4045  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.14 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344042  normal  0.123945 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  33.87 
 
 		 290 aa  85.5  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1220  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  27.65 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00652696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1343  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  27.65 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2510  rRNA adenine N-6-methyltransferase  27.65 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.65 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1747  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.65 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0257214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.65 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  29.89 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1713  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.65 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  31.44 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  25.22 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  33.93 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  24.15 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  25.45 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0508  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  32.72 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  29.06 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  35.62 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  30.94 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  33.53 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  31.49 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  29.36 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  28.21 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  31.49 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  30.27 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  26.84 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  28.25 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  30.27 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  27.42 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  27.42 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  28.37 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1812  dimethyladenosine transferase  23.17 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 		 281 aa  75.1  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  32.52 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2090  dimethyladenosine transferase  26.5 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  26.94 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1382  dimethyladenosine transferase  34.48 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.462909  normal  0.033279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  32.2 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  33.53 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  25.63 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  29.75 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3351  predicted protein  30.99 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  30.95 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  25.93 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  29.9 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  32.5 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  31.33 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  28.76 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  29.61 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28640  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  30.19 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  27.12 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  33.79 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  31.33 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  32.2 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  31.21 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  31.21 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  30.9 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  32.45 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  30.9 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  28.46 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  26.75 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  29.52 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0404  dimethyladenosine transferase  32.87 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.651839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  26.81 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  27.71 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1104  dimethyladenosine transferase  34.97 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0700  ribosomal RNA adenine methylase transferase  32.47 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000255838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  21.4 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  35.75 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  28.46 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  31.58 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  26.88 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  25.76 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  30 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  28.02 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  30.6 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  32.2 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  30.43 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  29.86 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>