More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0508 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0508  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 
313 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4045  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  54.41 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344042  normal  0.123945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  54.86 
 
 
265 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  58.57 
 
 
278 aa  252  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  56.03 
 
 
275 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  58.78 
 
 
266 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  53.54 
 
 
278 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.58 
 
 
256 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  39.32 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  30.89 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  27.24 
 
 
290 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  26.83 
 
 
290 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.12 
 
 
253 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  29.75 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  32.72 
 
 
244 aa  89  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.39 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  32.46 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  27.21 
 
 
288 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  25.77 
 
 
291 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 
287 aa  86.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  30.38 
 
 
263 aa  86.3  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  25.55 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  29.44 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  28.68 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  30.3 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  27.4 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  24.36 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1812  dimethyladenosine transferase  23.22 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  33.05 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  24.89 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  29.56 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  24.14 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  34.08 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  31.28 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  28.02 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  31.09 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  26.42 
 
 
292 aa  79  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  24.7 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  28.95 
 
 
262 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  30.88 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  25 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  31.32 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  32.14 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2090  dimethyladenosine transferase  23.13 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  29.72 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  31.91 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  29.89 
 
 
290 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  34.03 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  27.85 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  24.81 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  29.96 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  26.64 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  26.64 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  30.35 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  26.04 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  24.16 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  29.6 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  23.79 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  27.86 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  24.16 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  22.3 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  27.81 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  26.59 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  28.51 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  33.78 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  33.86 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  31.68 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  25.84 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  24.56 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  26.97 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  25.52 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  34.08 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  27.85 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  32.5 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  25.11 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  27.27 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  34.67 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  25.11 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  28.25 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  29 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  31.72 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  31.82 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  26.13 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  25.68 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2085  dimethyladenosine transferase  25.41 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00375521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  28.45 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  27.53 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  34.68 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  28.7 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>