More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0285 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
302 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  84.64 
 
 
297 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  60 
 
 
290 aa  329  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  49.66 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  44.09 
 
 
291 aa  225  8e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  43.88 
 
 
291 aa  223  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  42.45 
 
 
291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 
293 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 
305 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 
288 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  39.86 
 
 
288 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  38.41 
 
 
293 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 
299 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.1 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 
290 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  36.49 
 
 
281 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 
290 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  34.15 
 
 
285 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  34.15 
 
 
285 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  34.86 
 
 
292 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 
295 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 
278 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  35.5 
 
 
279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  34.56 
 
 
301 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  36.24 
 
 
290 aa  163  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  34.13 
 
 
296 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  30.98 
 
 
302 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
280 aa  161  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  36.76 
 
 
273 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  34.15 
 
 
292 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  36.96 
 
 
275 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  36.46 
 
 
290 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
273 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  33.57 
 
 
297 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  33.57 
 
 
297 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  34.48 
 
 
294 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  34.8 
 
 
271 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  35.53 
 
 
264 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  37.09 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 
271 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 
296 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  35.51 
 
 
276 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 
285 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 
281 aa  142  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0311  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.415808  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  37.12 
 
 
284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  36.63 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09471  dimethyladenosine transferase  34.28 
 
 
291 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0967055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  32.85 
 
 
276 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0278  dimethyladenosine transferase  34.28 
 
 
291 aa  138  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.525697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
275 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  34.3 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  34.93 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  29.9 
 
 
294 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  34.56 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  32.18 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  33.94 
 
 
285 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  31.23 
 
 
291 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1187  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3555  ribosomal RNA adenine methylase transferase  35.94 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.819299  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  32.89 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  33.88 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  34.35 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 
290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  31.62 
 
 
277 aa  130  3e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
281 aa  130  3e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  30.94 
 
 
459 aa  129  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  40.21 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
284 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
284 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  33.92 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1080  dimethyladenosine transferase  31.47 
 
 
293 aa  125  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  29.37 
 
 
261 aa  125  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  32.87 
 
 
293 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
268 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 
298 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
288 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  32.23 
 
 
259 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 
276 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
280 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0513  dimethyladenosine transferase  27.41 
 
 
273 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  29.93 
 
 
298 aa  122  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
265 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>