More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2596 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 		 278 aa  554  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  58.23 
 
 		 278 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  54.37 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4045  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  53.17 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344042  normal  0.123945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  56.75 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  54 
 
 		 275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0508  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  53.54 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.98 
 
 		 331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.57 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.08 
 
 		 253 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.63 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  32.21 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  34.36 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  28.51 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.38 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  33.76 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  26.72 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  28.25 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  26.74 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  23.95 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  33.18 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  26.91 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  29.59 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  31.78 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  34.57 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  34.57 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0513  dimethyladenosine transferase  24.36 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  30.22 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  32.83 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1381  ribosomal RNA adenine methylase transferase  27.37 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  30.26 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  29.25 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  34 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  33.51 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  35.75 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  30.53 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  30.99 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  37.06 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  30.45 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  33.17 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  27.31 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  27.04 
 
 		 295 aa  86.7  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  28.41 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  27.82 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  27.27 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  30.77 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  36.46 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  27.61 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  27.61 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  29.58 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  25.37 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  30.54 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  34.04 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  27.51 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  30.27 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  28.17 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  30.3 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28640  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  29.55 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  30.7 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  30.41 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  29.18 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  27.17 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  29.04 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  27.47 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  28.16 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  27.73 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  28.9 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  33.65 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  33.88 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  30.64 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  31.63 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75487  Dimethyladenosine transferase (S-adenosylmethionine-6-N', N'-adenosyl(rRNA) dimethyltransferase) (18S rRNA dimethylase)  32.79 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.368235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  30.46 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  29.26 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  33.51 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  24.02 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  27.84 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  29.51 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  29.65 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  30.05 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  24.81 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  25.1 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  28.89 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  30.14 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  30.1 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  33.51 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  35.5 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  30.52 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  31.97 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  24.63 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  29.41 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  28.35 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>