More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5229 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
293 aa  567  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  72.95 
 
 
316 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  71.58 
 
 
281 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  76.34 
 
 
287 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  70.32 
 
 
288 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  66.9 
 
 
302 aa  349  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  65.48 
 
 
298 aa  330  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  69.78 
 
 
297 aa  331  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  71.84 
 
 
324 aa  325  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  65.22 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  69.18 
 
 
300 aa  318  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  67.03 
 
 
320 aa  316  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05390  dimethyladenosine transferase  63.07 
 
 
307 aa  308  9e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0963646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  67.25 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  66.79 
 
 
289 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1283  dimethyladenosine transferase  62.68 
 
 
290 aa  305  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000558155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1952  dimethyladenosine transferase  63.77 
 
 
600 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  61.01 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  62.86 
 
 
281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2725  dimethyladenosine transferase  67.14 
 
 
303 aa  295  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  66.79 
 
 
289 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  60.49 
 
 
302 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  65.33 
 
 
284 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0906  dimethyladenosine transferase  67.73 
 
 
288 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00888376  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3232  dimethyladenosine transferase  60.9 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  55.67 
 
 
307 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0854  dimethyladenosine transferase  64.31 
 
 
319 aa  278  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  54.96 
 
 
294 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  54.96 
 
 
294 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  54.61 
 
 
294 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  54.29 
 
 
314 aa  275  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  53.57 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  51.24 
 
 
302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0767  dimethyladenosine transferase  62.63 
 
 
291 aa  268  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 
290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  58.99 
 
 
295 aa  266  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  54.18 
 
 
317 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3964  dimethyladenosine transferase  63.98 
 
 
251 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.77 
 
 
284 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  39.73 
 
 
293 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  37.87 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  39.37 
 
 
314 aa  182  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  34.03 
 
 
296 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
293 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
305 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  34.35 
 
 
297 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  34.35 
 
 
297 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
290 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.77 
 
 
291 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
292 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  40.49 
 
 
288 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 
299 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  31.86 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  40.44 
 
 
276 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  33.1 
 
 
295 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 
297 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  34.04 
 
 
290 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  40.81 
 
 
281 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
271 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
264 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 
278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  39.42 
 
 
279 aa  155  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 
284 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  31.37 
 
 
291 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 
267 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  39.3 
 
 
288 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
259 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 
289 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  33.21 
 
 
294 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  31.54 
 
 
292 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  37 
 
 
266 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  39.51 
 
 
297 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  38.77 
 
 
275 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  35.21 
 
 
275 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5257  dimethyladenosine transferase  42.35 
 
 
273 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
273 aa  148  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  39.34 
 
 
282 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
257 aa  148  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  35.09 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  39.86 
 
 
288 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  38.7 
 
 
265 aa  146  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  29.82 
 
 
290 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
267 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  32.16 
 
 
301 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>