More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3964 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3964  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 251 aa  467  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0767  dimethyladenosine transferase  80.33 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  61.94 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  62.2 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  63.45 
 
 		 288 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  60.91 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  63.01 
 
 		 293 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  59.58 
 
 		 305 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  59.35 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  61.22 
 
 		 281 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  62.76 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  63.16 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  63.01 
 
 		 300 aa  235  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  59.59 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  58.8 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1283  dimethyladenosine transferase  60.48 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000558155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  62.6 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  59.59 
 
 		 284 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  62.76 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  58.5 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  58.37 
 
 		 320 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 		 297 aa  215  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3232  dimethyladenosine transferase  57.25 
 
 		 310 aa  214  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05390  dimethyladenosine transferase  59.27 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0963646  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  53.47 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  47.77 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  49.8 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1952  dimethyladenosine transferase  56.1 
 
 		 600 aa  203  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  49.8 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  49.39 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  48.16 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2725  dimethyladenosine transferase  57.61 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  48.16 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  50.62 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  57.71 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0906  dimethyladenosine transferase  61.29 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00888376  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0854  dimethyladenosine transferase  54.31 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  40.31 
 
 		 293 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  39.36 
 
 		 288 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  35.57 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  36.44 
 
 		 294 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  37.15 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  41.81 
 
 		 278 aa  144  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  36.14 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  34.4 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  34.9 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  40.98 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  42.74 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  38.84 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 		 297 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  33.06 
 
 		 285 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  33.06 
 
 		 285 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  34.12 
 
 		 295 aa  131  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  33.6 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  33.88 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  33.88 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 		 302 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  33.07 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  33.07 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  33.07 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  34.15 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  32.34 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  34.13 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  31.91 
 
 		 287 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 296 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  27.24 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  33.6 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  31.36 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  36.93 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  34.47 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  30.77 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>