More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
284 aa  549  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  68.61 
 
 
298 aa  348  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  65.14 
 
 
302 aa  334  9e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  70.96 
 
 
289 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  65.82 
 
 
281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  65.6 
 
 
316 aa  324  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  65.6 
 
 
288 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  70.59 
 
 
289 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  62.95 
 
 
305 aa  315  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  59.35 
 
 
317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  63.04 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  64.44 
 
 
320 aa  301  6.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  65.33 
 
 
293 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3232  dimethyladenosine transferase  63.38 
 
 
310 aa  299  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  57.14 
 
 
294 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  57.14 
 
 
294 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  54.26 
 
 
302 aa  298  8e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  56.78 
 
 
294 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  61.51 
 
 
302 aa  295  8e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  61.59 
 
 
295 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  55.31 
 
 
314 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  55.31 
 
 
311 aa  292  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1283  dimethyladenosine transferase  63.04 
 
 
290 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000558155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  55.33 
 
 
307 aa  290  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  67.15 
 
 
324 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2725  dimethyladenosine transferase  64.18 
 
 
303 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  61.54 
 
 
297 aa  279  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  65.09 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1952  dimethyladenosine transferase  58.42 
 
 
600 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0906  dimethyladenosine transferase  64.98 
 
 
288 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00888376  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  59.93 
 
 
295 aa  271  7e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05390  dimethyladenosine transferase  60.99 
 
 
307 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0963646  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  64.86 
 
 
300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0767  dimethyladenosine transferase  62.77 
 
 
291 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  61.65 
 
 
306 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  51.8 
 
 
290 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0854  dimethyladenosine transferase  58.19 
 
 
319 aa  238  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3964  dimethyladenosine transferase  60.59 
 
 
251 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.82 
 
 
284 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 
288 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 
291 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  37.46 
 
 
293 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
296 aa  176  5e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
292 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
292 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  35.53 
 
 
290 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
292 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
292 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
292 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
292 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
292 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
292 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
292 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
292 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
292 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
290 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  42.6 
 
 
276 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  33.67 
 
 
302 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  36.78 
 
 
294 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  41.05 
 
 
299 aa  168  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
296 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  40.66 
 
 
279 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  34.83 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  34.83 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  35.89 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  33.56 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 
290 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 
285 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 
285 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
291 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  41.97 
 
 
281 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  39.78 
 
 
272 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  35.89 
 
 
285 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 
276 aa  158  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 
274 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  32.48 
 
 
280 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  34.56 
 
 
295 aa  156  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  40.36 
 
 
281 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  39.93 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  39.78 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 
264 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
269 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  40.52 
 
 
267 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  39.86 
 
 
273 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1080  dimethyladenosine transferase  31.65 
 
 
293 aa  151  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 
272 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 
290 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 
272 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 
272 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5257  dimethyladenosine transferase  41.95 
 
 
273 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  34.57 
 
 
269 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  34.2 
 
 
269 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 
267 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  42.41 
 
 
262 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 
301 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
266 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>