More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0767 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0767  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
291 aa  547  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  63.1 
 
 
316 aa  325  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  63.7 
 
 
281 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  63.57 
 
 
298 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  66.19 
 
 
288 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  62.14 
 
 
305 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3964  dimethyladenosine transferase  80.59 
 
 
251 aa  301  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  65.82 
 
 
289 aa  299  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  62.99 
 
 
293 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  60.78 
 
 
281 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  64.06 
 
 
300 aa  285  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1283  dimethyladenosine transferase  61.43 
 
 
290 aa  285  8e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000558155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  57.63 
 
 
302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  62.77 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  58.93 
 
 
302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05390  dimethyladenosine transferase  61.54 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0963646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  64.86 
 
 
289 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  58.57 
 
 
295 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  61.92 
 
 
297 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  62.28 
 
 
287 aa  271  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  58.25 
 
 
295 aa  271  8.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  64.06 
 
 
324 aa  271  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  63.25 
 
 
306 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  48.24 
 
 
302 aa  262  4e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  51.41 
 
 
311 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  51.41 
 
 
314 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3232  dimethyladenosine transferase  58.74 
 
 
310 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  51.76 
 
 
294 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  51.76 
 
 
294 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  51.41 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  51.55 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  58.57 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 
317 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1952  dimethyladenosine transferase  56.07 
 
 
600 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2725  dimethyladenosine transferase  59.07 
 
 
303 aa  249  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0906  dimethyladenosine transferase  62.72 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00888376  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  51.6 
 
 
290 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0854  dimethyladenosine transferase  55.96 
 
 
319 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 
293 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  39.3 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 
284 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  33.1 
 
 
305 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 
291 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  41.45 
 
 
279 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  36.81 
 
 
293 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 
292 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  30.85 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  35.16 
 
 
294 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  37.33 
 
 
314 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 
296 aa  161  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  40.45 
 
 
271 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  35.21 
 
 
290 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  32.3 
 
 
296 aa  155  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 
290 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
274 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  40.83 
 
 
284 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  31.99 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  31.99 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 
257 aa  152  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 
292 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  34.75 
 
 
290 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  34.32 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  31.67 
 
 
291 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  32.64 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  34.33 
 
 
287 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  32.04 
 
 
301 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 
288 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  33.9 
 
 
289 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  31.63 
 
 
297 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  31.63 
 
 
297 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
271 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
264 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  30.66 
 
 
294 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  41.01 
 
 
281 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  37.91 
 
 
285 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  39.21 
 
 
276 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  38.25 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 
285 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2658  ribosomal RNA adenine methylase transferase  35.74 
 
 
347 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  40.7 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  32.86 
 
 
262 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  37.19 
 
 
290 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
269 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  32.96 
 
 
296 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  33.68 
 
 
297 aa  137  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>