More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2658 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2658  ribosomal RNA adenine methylase transferase  100 
 
 
347 aa  693    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  51.78 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  53.82 
 
 
296 aa  300  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  42.86 
 
 
314 aa  233  3e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  36.66 
 
 
293 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  32.63 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  34.02 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  32.46 
 
 
293 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  34.13 
 
 
297 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  34.13 
 
 
297 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  33.63 
 
 
302 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  33.63 
 
 
296 aa  162  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  32.65 
 
 
291 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  31.82 
 
 
297 aa  157  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  33.23 
 
 
285 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  33.23 
 
 
285 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  34.06 
 
 
305 aa  156  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  31.1 
 
 
305 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  32.74 
 
 
294 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  32.56 
 
 
294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  32.56 
 
 
294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 
299 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  31.83 
 
 
314 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
294 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  31.14 
 
 
290 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  32.76 
 
 
291 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  31.53 
 
 
311 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  32.17 
 
 
292 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  32.66 
 
 
307 aa  149  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  35.21 
 
 
302 aa  149  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  32.24 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  31.76 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  31.76 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  31.76 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  31.76 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  31.76 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  31.76 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  31.76 
 
 
292 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  31.76 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  32.74 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  29.51 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  31.47 
 
 
292 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  31.47 
 
 
292 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  31.36 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  35.13 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  30.79 
 
 
301 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  34.11 
 
 
281 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  32.43 
 
 
317 aa  143  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  31.74 
 
 
291 aa  143  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  33.63 
 
 
288 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  35.8 
 
 
302 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  34.65 
 
 
316 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  31.34 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  33.04 
 
 
290 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  30.68 
 
 
292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  29.43 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  33.14 
 
 
297 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  30.18 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  35.4 
 
 
271 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  33.23 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  32.85 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  29.88 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  29.88 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  35.21 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  32.41 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  34.97 
 
 
289 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  34.37 
 
 
287 aa  133  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 
284 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  33.75 
 
 
275 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  33.73 
 
 
284 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  33.43 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 
280 aa  132  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  30.84 
 
 
285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  31.41 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  31.31 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  33.05 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 
289 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  31.45 
 
 
285 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  33.73 
 
 
281 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  27.25 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  33.83 
 
 
276 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  34.25 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  34.25 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  35.44 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0854  dimethyladenosine transferase  35.31 
 
 
319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  29.57 
 
 
294 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  33.43 
 
 
295 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  34.08 
 
 
297 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6886  dimethyladenosine transferase  31.53 
 
 
295 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  30.31 
 
 
275 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  35.56 
 
 
306 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  30.63 
 
 
262 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  33.03 
 
 
278 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  32.74 
 
 
302 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  32.81 
 
 
263 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  32.2 
 
 
275 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>