More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0528 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  53.98 
 
 		 244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  53.49 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  51.42 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  42.11 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  39.05 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  39.9 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.84 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4045  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  38.57 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344042  normal  0.123945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.55 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  32.42 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  29.34 
 
 		 297 aa  99  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  34.3 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  28.86 
 
 		 296 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 		 290 aa  96.3  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  32.23 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 		 294 aa  95.9  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  25.3 
 
 		 291 aa  92.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  28.7 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  31.75 
 
 		 331 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1080  dimethyladenosine transferase  23.85 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  32.92 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  31.1 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  33 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  29.36 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  29.76 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  33 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1571  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.836645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  29.46 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  35.26 
 
 		 297 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  29.61 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  25.97 
 
 		 267 aa  88.6  8e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  25.6 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  32.65 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  27.71 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1812  dimethyladenosine transferase  26.95 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  30.7 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  31.02 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  30.56 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1104  dimethyladenosine transferase  32.85 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 		 302 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  31.98 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  31.58 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0004  dimethyladenosine transferase  23.66 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.50922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  37.97 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  30.48 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  27.64 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  28.99 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  32.65 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  27.67 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2090  dimethyladenosine transferase  28.57 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1867  dimethyladenosine transferase  30.43 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  25.96 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  28.64 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  34.16 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  32.13 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  38.07 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  32.68 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  30.4 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  32.28 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  30.23 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  25.33 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  31 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  30.23 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  31.84 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  25.91 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  28.96 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  32.68 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1220  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  23.71 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00652696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1343  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  23.71 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2510  rRNA adenine N-6-methyltransferase  23.71 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.71 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1747  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.71 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0257214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1713  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.71 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.71 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  28.75 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  30.92 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  30 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1382  dimethyladenosine transferase  31.84 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.462909  normal  0.033279 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  29.65 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  29.81 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  32.28 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3351  predicted protein  29.79 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  33.82 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  31.43 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1871  dimethyladenosine transferase  30.45 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>