More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4551 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 
275 aa  554  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  61.35 
 
 
278 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0508  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  56.7 
 
 
313 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  50.98 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  52.57 
 
 
278 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4045  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  50.58 
 
 
269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344042  normal  0.123945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  54.26 
 
 
266 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  40.1 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  33.58 
 
 
331 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.19 
 
 
263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  32.9 
 
 
269 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  34.14 
 
 
290 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  35.75 
 
 
262 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  32.54 
 
 
256 aa  99.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  32.24 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  33.19 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  36.93 
 
 
244 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  31.13 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  33.5 
 
 
292 aa  94  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  35.62 
 
 
298 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0550  dimethyladenosine transferase  42.25 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.659691  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.09 
 
 
253 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  30.65 
 
 
320 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  32.06 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  33.15 
 
 
243 aa  89.4  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  28.18 
 
 
279 aa  89  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  31.63 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28640  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  37.29 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  30.7 
 
 
261 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  30.46 
 
 
291 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  31.6 
 
 
302 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  30.66 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  34.39 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  29.54 
 
 
273 aa  85.5  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  35.51 
 
 
305 aa  85.5  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  31.48 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  35.08 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  27.31 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  35.05 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  29.66 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  30.43 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  31.03 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  32.43 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  30.19 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  28.93 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  30.81 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  30 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  27.69 
 
 
305 aa  82  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 
288 aa  82  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  31.52 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  32.29 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  28.8 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  32.29 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0791  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75487  Dimethyladenosine transferase (S-adenosylmethionine-6-N', N'-adenosyl(rRNA) dimethyltransferase) (18S rRNA dimethylase)  31.75 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.368235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1958  dimethyladenosine transferase  39.11 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.331165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  24.19 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  31.11 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  31.77 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  31.54 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  35.08 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  29.76 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  30.24 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  33.68 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  35.87 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  28.38 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  35.6 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  35.79 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  34.26 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  28.84 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  30.99 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  33.76 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  36.22 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  28.03 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  28.03 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  32.22 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03313  dimethyladenosine transferase (AFU_orthologue; AFUA_7G04860)  29.6 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.816123 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  35.83 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  29.87 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  31.47 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  32.34 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  30.26 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  29.39 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  31.88 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  28.78 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  33.15 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  29.39 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  21.37 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  30.19 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  29.39 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  29 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  29.47 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  32.91 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>