More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3490 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 		 278 aa  551  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  61.35 
 
 		 275 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  57.03 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  58.23 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4045  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  54.98 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344042  normal  0.123945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0508  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  57.65 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  57.37 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  42.11 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  37.1 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  33.33 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  33.93 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  31.5 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  32.59 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  34.38 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  34.1 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  29.55 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  24.42 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  33.47 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  27.41 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  39.11 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  28.23 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  28.23 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  39.19 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  31 
 
 		 320 aa  102  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  29.34 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.25 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  32.46 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  29.44 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  30.45 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  32.97 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  30.37 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  31.18 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  32.12 
 
 		 302 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  27 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  34.91 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  31.74 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  27.76 
 
 		 262 aa  95.9  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  36.32 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  27.62 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  28.47 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  30.32 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 		 305 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0791  dimethyladenosine transferase  31.8 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  37.16 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  28.02 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  35.68 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75487  Dimethyladenosine transferase (S-adenosylmethionine-6-N', N'-adenosyl(rRNA) dimethyltransferase) (18S rRNA dimethylase)  28.26 
 
 		 323 aa  92.8  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.368235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  35.32 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  28.83 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 		 292 aa  92  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  31.49 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  30.26 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  26.53 
 
 		 294 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  32.08 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  33.93 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  32.08 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  30.45 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  26.05 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  34.38 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  29.11 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00110  rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase, putative  27.66 
 
 		 325 aa  89.4  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0222331  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  35.16 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  29.46 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  21.13 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  31.35 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  29.44 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  31.05 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  31.58 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  31.92 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  28.51 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  27.76 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  28.81 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  25.29 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  26.38 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  29.46 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  26.98 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  25.79 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19122  predicted protein  26.69 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  27.35 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  27.52 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  27.52 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03313  dimethyladenosine transferase (AFU_orthologue; AFUA_7G04860)  27.75 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.816123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  34.82 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  30.48 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  25.9 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  31.02 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  34.05 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 		 324 aa  82  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>