More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2090 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2090  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
267 aa  550  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0062  dimethyladenosine transferase  48.38 
 
 
281 aa  254  8e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1746  dimethyladenosine transferase  45.63 
 
 
269 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1812  dimethyladenosine transferase  47.58 
 
 
268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1888  dimethyladenosine transferase  43.48 
 
 
280 aa  232  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1116  dimethyladenosine transferase  43.89 
 
 
285 aa  224  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0005  dimethyladenosine transferase  43.35 
 
 
266 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0129595  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1880  dimethyladenosine transferase  43.35 
 
 
266 aa  216  4e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.846043  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2085  dimethyladenosine transferase  42.97 
 
 
266 aa  214  8e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00375521  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0019  dimethyladenosine transferase  41.25 
 
 
273 aa  196  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 
267 aa  139  3e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  34.67 
 
 
290 aa  139  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  38.29 
 
 
264 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1187  dimethyladenosine transferase  33.21 
 
 
274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  34.48 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  36.08 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  34.2 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  36.22 
 
 
267 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
293 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  32.81 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  35.07 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  36.22 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  33.72 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  34.39 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  34.57 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  34.39 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  32.33 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  34.39 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  35.07 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  33.85 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  34.63 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  35.16 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  33.08 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  33.08 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  34.67 
 
 
278 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  33.1 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  34.38 
 
 
281 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  35.18 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  32.83 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  33.2 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  33.81 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  32.26 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  34.25 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  33.87 
 
 
266 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  32.81 
 
 
269 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  34.65 
 
 
268 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  33.2 
 
 
256 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
297 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 
282 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  33.21 
 
 
278 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  31.47 
 
 
262 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  34.73 
 
 
305 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  32.3 
 
 
257 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 
275 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  31.34 
 
 
285 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  30.6 
 
 
266 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  33.87 
 
 
266 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  34.47 
 
 
290 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  31.52 
 
 
272 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
285 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1571  dimethyladenosine transferase  33.76 
 
 
264 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.836645  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  32.02 
 
 
276 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  33.21 
 
 
294 aa  122  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  33.87 
 
 
267 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  32.72 
 
 
284 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  32.81 
 
 
272 aa  121  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  33.2 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  30.63 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  33.2 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0603  dimethyladenosine transferase  33.98 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  30.12 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07111  dimethyladenosine transferase  31.87 
 
 
282 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.139914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  33.47 
 
 
267 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  30.77 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  34.65 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  32.82 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  34.65 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0501  dimethyladenosine transferase  29.25 
 
 
270 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000511271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  33.2 
 
 
301 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  30.38 
 
 
272 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  36.32 
 
 
267 aa  118  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>