More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1187 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1187  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
274 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16171  dimethyladenosine transferase  73.72 
 
 
280 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  74.63 
 
 
274 aa  391  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07111  dimethyladenosine transferase  59.12 
 
 
282 aa  321  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.139914 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09471  dimethyladenosine transferase  54.51 
 
 
291 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0967055 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0278  dimethyladenosine transferase  54.51 
 
 
291 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.525697  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10161  dimethyladenosine transferase  42.38 
 
 
276 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09271  dimethyladenosine transferase  43.12 
 
 
274 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0866  dimethyladenosine transferase  42.38 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09251  dimethyladenosine transferase  42.75 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  45.72 
 
 
281 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0311  dimethyladenosine transferase  49.08 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.415808  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  45.76 
 
 
277 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  46.42 
 
 
284 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  44.15 
 
 
273 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  43.54 
 
 
271 aa  205  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  43.91 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  43.66 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  44.91 
 
 
271 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  39.19 
 
 
276 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  38.83 
 
 
273 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  40.74 
 
 
268 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 
275 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 
266 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
267 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
281 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  39.35 
 
 
275 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 
278 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
267 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 
268 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 
266 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 
272 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  39.78 
 
 
281 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
268 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 
276 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
281 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 
275 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 
275 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 
275 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  38.75 
 
 
277 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
276 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 
268 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  35.09 
 
 
276 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  36.75 
 
 
278 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  34.81 
 
 
268 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  41.05 
 
 
264 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
268 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  38.29 
 
 
282 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
268 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 
275 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
268 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 
275 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
268 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
267 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 
259 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 
275 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 
275 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 
275 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 
275 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 
275 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  39.93 
 
 
263 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 
275 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 
272 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 
267 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  34.56 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
258 aa  145  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  34.93 
 
 
269 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 
268 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 
268 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  37.27 
 
 
255 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 
271 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 
268 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 
268 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  36.67 
 
 
264 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 
268 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  37.87 
 
 
276 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  39.03 
 
 
280 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  34.59 
 
 
267 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
269 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6704  predicted protein  35.69 
 
 
268 aa  142  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.477896  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  30.35 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  35.32 
 
 
256 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  34.59 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  34.59 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  36.03 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  34.46 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  34.27 
 
 
297 aa  139  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  35.19 
 
 
256 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  38.24 
 
 
275 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 
275 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
262 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
267 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
287 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>