More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0278 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0278  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.525697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09471  dimethyladenosine transferase  97.25 
 
 
291 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0967055 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07111  dimethyladenosine transferase  57.46 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.139914 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  57.62 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1187  dimethyladenosine transferase  54.51 
 
 
274 aa  295  6e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16171  dimethyladenosine transferase  53.11 
 
 
280 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10161  dimethyladenosine transferase  43.54 
 
 
276 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09271  dimethyladenosine transferase  44.57 
 
 
274 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0866  dimethyladenosine transferase  44.57 
 
 
276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09251  dimethyladenosine transferase  43.84 
 
 
274 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  45.59 
 
 
272 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  45.59 
 
 
272 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0311  dimethyladenosine transferase  47.41 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.415808  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  42.86 
 
 
281 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  41.97 
 
 
284 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  43.8 
 
 
271 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  43.4 
 
 
273 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  41.91 
 
 
277 aa  193  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  35.51 
 
 
268 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
268 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  39.64 
 
 
275 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  35.14 
 
 
269 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  42.98 
 
 
271 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  39.03 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  39.19 
 
 
275 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 
281 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  34.91 
 
 
276 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
253 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  39.19 
 
 
276 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
268 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
268 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  38.83 
 
 
275 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  38.83 
 
 
275 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  38.83 
 
 
275 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
255 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  38.83 
 
 
273 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
253 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 
276 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  38.29 
 
 
281 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 
272 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4762  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
253 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  40.25 
 
 
263 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  36.16 
 
 
268 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 
278 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  35.53 
 
 
264 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  37 
 
 
272 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
276 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  37 
 
 
272 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  35.04 
 
 
266 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  35.4 
 
 
269 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  34.81 
 
 
272 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  34.16 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  34.81 
 
 
266 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  36.76 
 
 
264 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 
256 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  35.93 
 
 
285 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  36.1 
 
 
275 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  36.1 
 
 
275 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  32.09 
 
 
255 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  33.21 
 
 
284 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  34.67 
 
 
267 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
278 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  34.67 
 
 
267 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 
282 aa  148  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  35.07 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  35.79 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  36.11 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 
268 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 
269 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 
268 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
266 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  34.44 
 
 
259 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  34.52 
 
 
274 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 
298 aa  145  6e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 
267 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 
297 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 
284 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
268 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
272 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  34.96 
 
 
267 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
272 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
272 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
272 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 
268 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 
267 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>