29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3689 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  87.64 
 
 
268 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  77.32 
 
 
327 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  67.17 
 
 
267 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  67.17 
 
 
267 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  40 
 
 
557 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  36.33 
 
 
269 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  35.29 
 
 
277 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  36.56 
 
 
277 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  33.7 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  33.7 
 
 
282 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  41.79 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  40.72 
 
 
282 aa  161  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  41.23 
 
 
277 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  32.59 
 
 
280 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  32.34 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  33.94 
 
 
281 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 
281 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  32.96 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  32.96 
 
 
288 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  31.85 
 
 
280 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  33.09 
 
 
288 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  33.09 
 
 
289 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  38.85 
 
 
189 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  38.85 
 
 
189 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  38.12 
 
 
481 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  34.43 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  27.17 
 
 
548 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  23.92 
 
 
450 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>