30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1283 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  37.83 
 
 		 327 aa  188  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  38.2 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  36.33 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  35.09 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  35.09 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  37.68 
 
 		 557 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  30.77 
 
 		 277 aa  138  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  30.4 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  34.3 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  32.04 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  32.85 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  29.82 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  28.47 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  34.47 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  28.73 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  28.36 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  28 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  27.27 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  29.85 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  31.6 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  37.58 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  37.58 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  27.32 
 
 		 548 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  25.62 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  24.31 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  24.88 
 
 		 449 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  21.83 
 
 		 597 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>