29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5396 on replicon NC_012851
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  553  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  553  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  72.18 
 
 
327 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  68.82 
 
 
268 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  67.17 
 
 
268 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  37.94 
 
 
557 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  35.09 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  42.16 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  34.94 
 
 
277 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  34.57 
 
 
277 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  40.39 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  33.09 
 
 
282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  34.19 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  34.19 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  33.46 
 
 
280 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  32.84 
 
 
281 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  33.46 
 
 
280 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  32.22 
 
 
280 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  37.93 
 
 
288 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  29.56 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  41.14 
 
 
189 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  41.14 
 
 
189 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  33.49 
 
 
481 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  26.57 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  30.41 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
450 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>