29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2239 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  587  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  95 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  93.19 
 
 		 281 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  93.55 
 
 		 289 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  91.76 
 
 		 288 aa  542  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  88.93 
 
 		 280 aa  534  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  87.05 
 
 		 281 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  87.05 
 
 		 281 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  67.88 
 
 		 277 aa  397  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  65.23 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  64.29 
 
 		 282 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  61.03 
 
 		 277 aa  360  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  59.49 
 
 		 277 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  58.61 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  82.32 
 
 		 189 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  82.32 
 
 		 189 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  37.13 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  33.68 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  34.2 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  33.46 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  33.46 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  32.59 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  31.41 
 
 		 557 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  28.36 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  30.62 
 
 		 481 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  25.67 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2144  eutP/pduV family protein  55.38 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  25.14 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>