29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3215 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  93.75 
 
 
289 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  93.55 
 
 
280 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  91.76 
 
 
280 aa  542  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  91.76 
 
 
281 aa  541  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  89.64 
 
 
281 aa  530  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  89.64 
 
 
281 aa  530  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  88.21 
 
 
280 aa  524  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  67.52 
 
 
277 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  66.05 
 
 
288 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  63.35 
 
 
282 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  60.29 
 
 
277 aa  354  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  59.12 
 
 
277 aa  350  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  57.66 
 
 
277 aa  324  9e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  82.93 
 
 
189 aa  295  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  82.93 
 
 
189 aa  295  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  39.13 
 
 
282 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  39.13 
 
 
282 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  34.93 
 
 
268 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  37.93 
 
 
267 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  34.56 
 
 
327 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  37.93 
 
 
267 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  32.96 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  31.32 
 
 
557 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  28.73 
 
 
269 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  29.52 
 
 
481 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  25 
 
 
548 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2144  eutP/pduV family protein  61.02 
 
 
121 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  23.2 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>