28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3129 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  75.45 
 
 
277 aa  435  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  70.44 
 
 
277 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  70.04 
 
 
277 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  69.68 
 
 
277 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  69.42 
 
 
288 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  65.96 
 
 
281 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  65.96 
 
 
281 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  66.19 
 
 
289 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  65.25 
 
 
281 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  65 
 
 
280 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  64.29 
 
 
280 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  63.35 
 
 
288 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  62.28 
 
 
280 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  63.58 
 
 
189 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  63.58 
 
 
189 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  38.27 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  38.27 
 
 
282 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  35.66 
 
 
268 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  35.69 
 
 
557 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  35.29 
 
 
327 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  33.09 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  33.09 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  40.72 
 
 
268 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  29.85 
 
 
269 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  29.49 
 
 
481 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  25.48 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  21.72 
 
 
548 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>