29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1409 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  95 
 
 
280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  93.91 
 
 
289 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  93.55 
 
 
288 aa  548  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  93.19 
 
 
281 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  90.71 
 
 
280 aa  541  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  88.13 
 
 
281 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  88.13 
 
 
281 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  67.52 
 
 
277 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  66.18 
 
 
288 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  65 
 
 
282 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  61.76 
 
 
277 aa  361  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  60.22 
 
 
277 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  59.34 
 
 
277 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  83.54 
 
 
189 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  83.54 
 
 
189 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  37.64 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  37.27 
 
 
282 aa  171  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  34.66 
 
 
268 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  33.46 
 
 
267 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  33.46 
 
 
267 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  34.57 
 
 
327 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  32.96 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  31.41 
 
 
557 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  28 
 
 
269 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  30.29 
 
 
481 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2144  eutP/pduV family protein  61.19 
 
 
121 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  26.2 
 
 
548 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  24.64 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>