29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03483 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  590  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  590  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  89.29 
 
 
289 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  89.64 
 
 
288 aa  530  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  89.21 
 
 
281 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  88.13 
 
 
280 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  87.05 
 
 
280 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  83.93 
 
 
280 aa  501  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  68.73 
 
 
277 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  67.03 
 
 
288 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  65.96 
 
 
282 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  61.9 
 
 
277 aa  363  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  61.09 
 
 
277 aa  362  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  60.73 
 
 
277 aa  346  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  82.32 
 
 
189 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  82.32 
 
 
189 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  37.86 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  37.5 
 
 
282 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  36.26 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  34.19 
 
 
267 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  34.19 
 
 
267 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  34.8 
 
 
327 aa  161  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  33.94 
 
 
268 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.81 
 
 
557 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  29.41 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  31.92 
 
 
481 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  24.87 
 
 
548 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  23.2 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2144  eutP/pduV family protein  45.76 
 
 
121 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>