18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2144 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2144  eutP/pduV family protein  100 
 
 
121 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1056  hypothetical protein  93.98 
 
 
118 aa  163  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01895  hypothetical protein  92.86 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2297  propanediol utilization protein PduV  86.67 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2861  hypothetical protein  94.74 
 
 
39 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0469704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  61.19 
 
 
280 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  59.7 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  58.21 
 
 
280 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2233  ethanolamine utilization protein EutP  46.67 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2279  ethanolamine utilization protein, EutP  46.67 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0106069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2392  ethanolamine utilization protein, EutP  46.67 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2179  ethanolamine utilization protein, EutP  46.67 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2226  ethanolamine utilization protein, EutP  45 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.183442  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  61.02 
 
 
289 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  61.02 
 
 
288 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  55.38 
 
 
280 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  45.76 
 
 
281 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  45.76 
 
 
281 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>