27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1886 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  34.43 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  29.17 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  33.15 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  26.57 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  26.57 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  25.48 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  26.05 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  24.72 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  26.62 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  22.93 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  25.4 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  24.31 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  25.27 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  24.91 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  24.37 
 
 
481 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  25.12 
 
 
289 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  25.14 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  23.2 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  23.2 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  25.51 
 
 
281 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  24.64 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  23.2 
 
 
288 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  25.51 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 
189 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  27.15 
 
 
189 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  24.64 
 
 
557 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>