219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1366 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1366  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  454  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.229777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  26.7 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  26.7 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.36 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  25.91 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.36 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25.91 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.36 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
253 aa  68.2  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  26.5 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  25.84 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  25.84 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  27.88 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  25.57 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  25.57 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  26.63 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0584  hypothetical protein  27.4 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  32.11 
 
 
258 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  26.63 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1672  Methyltransferase type 12  49.09 
 
 
265 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  24.55 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  24.85 
 
 
256 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  24.09 
 
 
249 aa  61.6  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  23.15 
 
 
272 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  29.69 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  25.22 
 
 
259 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  26.7 
 
 
262 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  30.28 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  30.19 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  28.83 
 
 
315 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  30.28 
 
 
254 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  31.82 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  29.36 
 
 
254 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 
254 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  29.36 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  29.36 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.81 
 
 
266 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  28.44 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  29.36 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  29.36 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  29.36 
 
 
254 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  26.67 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1246  methyltransferase  23.79 
 
 
253 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  25.64 
 
 
252 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  26 
 
 
262 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  23.71 
 
 
239 aa  52  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
240 aa  51.6  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  28.44 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  29.57 
 
 
575 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  30.56 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  26.17 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  24.2 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  24.2 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
2490 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3090  hypothetical protein  27.43 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  30.84 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  29.81 
 
 
247 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  24.89 
 
 
256 aa  48.9  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  27.93 
 
 
243 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  23.49 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
262 aa  48.5  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
253 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  27 
 
 
280 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  28.7 
 
 
239 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  28.87 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  23.2 
 
 
280 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  23.2 
 
 
280 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 
248 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  24.78 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  25.68 
 
 
267 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  47.27 
 
 
265 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  24.17 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.03 
 
 
244 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
286 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  23.21 
 
 
256 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  25.49 
 
 
263 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  20.51 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  23.16 
 
 
277 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0127  methyltransferase type 12  23.74 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
335 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  26.19 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>