More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1868 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  62.01 
 
 		 188 aa  218  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  59.66 
 
 		 188 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  47.83 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  52.17 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  51.85 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  51.35 
 
 		 193 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  45.81 
 
 		 208 aa  147  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  45.4 
 
 		 204 aa  141  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  41.92 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  41.53 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  44.86 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  46.15 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  34.55 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  36.75 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  36.75 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  36.97 
 
 		 202 aa  104  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  36.97 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  30.1 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  37.06 
 
 		 223 aa  84.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  27.89 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  28.96 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  33.97 
 
 		 226 aa  80.9  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  36.52 
 
 		 227 aa  77.8  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  28.51 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  33.16 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  36.11 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  34.09 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  34.74 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  38.66 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  27.17 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  36.42 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  35.75 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.5 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  39.86 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  33.72 
 
 		 258 aa  67.8  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  39.86 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  33.15 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  33.33 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.14 
 
 		 288 aa  64.7  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  32.2 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  28.77 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.57 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.33 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.53 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  33.11 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  33.15 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.12 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  31.18 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  33.15 
 
 		 230 aa  62  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  36.18 
 
 		 336 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1394  hypothetical protein  41.24 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.89 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  34.67 
 
 		 345 aa  61.2  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  34.36 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.11 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  33.06 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  33.11 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.53 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  34.46 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  36 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  33.06 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  32.94 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  33.54 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  32.77 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  32.04 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  35.1 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  28.22 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  33.12 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  33.56 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  33.61 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  33.56 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.77 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  31.18 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  31.35 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  33.56 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.93 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  31.25 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  33.15 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  30.14 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  34.08 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  36.69 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  31.33 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  31.97 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  33.91 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  28.99 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  35.42 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  30.94 
 
 		 283 aa  57.8  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  35.81 
 
 		 280 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  33.56 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  34.43 
 
 		 377 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  32.88 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  31.07 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  31.82 
 
 		 386 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  34.19 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.44 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.94 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  31.51 
 
 		 286 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  32.34 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>