91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53410 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  100 
 
 
232 aa  477  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02104  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
264 aa  153  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.563309 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5532  predicted protein  29.92 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  31.33 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  31.51 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  28.57 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  28.84 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  28.51 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  29.68 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  27.85 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  27.15 
 
 
208 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  26.64 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  30.52 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  28.05 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  31.74 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  28.9 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  28.7 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  25.35 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  25.45 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  26.75 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  27.19 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04120  conserved hypothetical protein  32.62 
 
 
165 aa  62.8  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.26 
 
 
202 aa  62  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  29.73 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  24.43 
 
 
177 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  26.46 
 
 
193 aa  56.2  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  26.74 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  25.99 
 
 
179 aa  52  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  26 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  22.75 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  27.59 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  30.33 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  26.51 
 
 
288 aa  50.1  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  24.19 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  30.58 
 
 
286 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  34.12 
 
 
286 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  27.74 
 
 
275 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  23.94 
 
 
178 aa  48.5  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  26.47 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  26.58 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  25.42 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.94 
 
 
286 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  24.18 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  27.66 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  26.95 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.58 
 
 
289 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  30.39 
 
 
587 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0811  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 
258 aa  45.4  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.350613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  23.26 
 
 
285 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  24.66 
 
 
271 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  24.84 
 
 
298 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  25.17 
 
 
304 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  24.32 
 
 
313 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  38.98 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  29.41 
 
 
587 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  28.97 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  27.97 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  24.31 
 
 
297 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  29.6 
 
 
280 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  31.19 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2774  hypothetical protein  27.5 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.7 
 
 
293 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  26.06 
 
 
325 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  25.68 
 
 
283 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  27.2 
 
 
287 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  25.81 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  23.84 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  24.85 
 
 
278 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.35 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  28.23 
 
 
284 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3613  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.26 
 
 
325 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.283182  normal  0.0446464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  23.63 
 
 
307 aa  42.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0806  modification methylase, HemK family  26.32 
 
 
282 aa  42.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.405188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  26.67 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.47 
 
 
307 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1540  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  24.67 
 
 
309 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0745  HemK family modification methylase  26.26 
 
 
271 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.150019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  22.53 
 
 
361 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  29.46 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.35 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  24 
 
 
273 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.03 
 
 
302 aa  42  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0128  HemK family modification methylase  23.97 
 
 
289 aa  42  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1284  HemK family modification methylase  26.26 
 
 
271 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  27.86 
 
 
288 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  27.21 
 
 
283 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  28.23 
 
 
288 aa  42  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  26.16 
 
 
289 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  23.5 
 
 
261 aa  41.6  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  26.36 
 
 
289 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.16 
 
 
340 aa  41.6  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>