258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2106 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2106  methylase  100 
 
 
199 aa  391  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  58.5 
 
 
202 aa  214  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  61.14 
 
 
193 aa  202  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  58.03 
 
 
208 aa  201  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  57.84 
 
 
204 aa  192  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  50.28 
 
 
188 aa  159  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  55.06 
 
 
188 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  42.62 
 
 
202 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  46.15 
 
 
185 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  46.49 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  46.2 
 
 
185 aa  139  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  40.33 
 
 
202 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  45.86 
 
 
164 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  32.79 
 
 
208 aa  116  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  35.71 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  36.46 
 
 
202 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  37.36 
 
 
202 aa  111  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  33.7 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  27.96 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  34.07 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  34.95 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  27.78 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  25.15 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  27.63 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  27.36 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  34.62 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.95 
 
 
283 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  35.26 
 
 
288 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  31.02 
 
 
249 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  28.92 
 
 
225 aa  62.4  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  31.82 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  30.73 
 
 
235 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  31.96 
 
 
230 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  32.62 
 
 
297 aa  57.4  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  35.71 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  34.9 
 
 
378 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  34.78 
 
 
515 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.28 
 
 
284 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  36.26 
 
 
287 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.34 
 
 
288 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.92 
 
 
286 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
280 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0569  modification methylase, HemK family  26.79 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  32 
 
 
281 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5532  predicted protein  28.77 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  35.8 
 
 
286 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  28.57 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  31.33 
 
 
288 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  31.21 
 
 
292 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  32.95 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  32.86 
 
 
572 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  32.24 
 
 
307 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  34.25 
 
 
307 aa  52  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  34.07 
 
 
231 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  34.07 
 
 
231 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.82 
 
 
299 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  34.01 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.81 
 
 
280 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1284  HemK family modification methylase  30.4 
 
 
271 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0745  HemK family modification methylase  30.4 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.150019  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1394  hypothetical protein  42.86 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  33.68 
 
 
345 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  34.81 
 
 
280 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  31.14 
 
 
279 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  32.97 
 
 
414 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  24.12 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  31.76 
 
 
374 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  34.4 
 
 
288 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.58 
 
 
286 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  29.11 
 
 
404 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  32.8 
 
 
284 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.29 
 
 
286 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0895  HemK family modification methylase  28.35 
 
 
258 aa  48.9  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00424484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  26.47 
 
 
293 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  32.45 
 
 
227 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  31.08 
 
 
549 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.82 
 
 
277 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  32.76 
 
 
270 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  30.81 
 
 
287 aa  48.5  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  32.67 
 
 
359 aa  48.5  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  31.82 
 
 
296 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.53 
 
 
283 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  29.1 
 
 
536 aa  48.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.22 
 
 
285 aa  48.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  29.77 
 
 
283 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  36.96 
 
 
275 aa  48.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_002620  TC0293  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.29 
 
 
290 aa  47.8  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  31.82 
 
 
304 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0822  HemK family modification methylase  29.6 
 
 
271 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.21973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.77 
 
 
283 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  32.09 
 
 
297 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  32.67 
 
 
291 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  31.25 
 
 
325 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.82 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  32.98 
 
 
274 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.82 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.82 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  30.15 
 
 
283 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.82 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  30.95 
 
 
274 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>