294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3772 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  100 
 
 
227 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  49.3 
 
 
226 aa  215  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4470  methyltransferase small  47.03 
 
 
223 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.820054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  35.16 
 
 
382 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  26.42 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  34.21 
 
 
377 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  39.16 
 
 
301 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  32.48 
 
 
378 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  32.93 
 
 
297 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.62 
 
 
303 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  26.28 
 
 
202 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  29.93 
 
 
307 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  24.28 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  31.67 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  34.48 
 
 
414 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  26.45 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  30.36 
 
 
381 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  33.55 
 
 
377 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  33.12 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  31.13 
 
 
368 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  30.25 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.37 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  29.03 
 
 
390 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  33.55 
 
 
425 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  32.68 
 
 
296 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  33.83 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.58 
 
 
317 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  32.89 
 
 
377 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  29.03 
 
 
390 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  32.89 
 
 
396 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  32.89 
 
 
378 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  32.89 
 
 
378 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  32.89 
 
 
378 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  32.89 
 
 
378 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  32.89 
 
 
378 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  25.32 
 
 
279 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  35.07 
 
 
578 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  32.24 
 
 
378 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  30.46 
 
 
374 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  30.46 
 
 
379 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  30.46 
 
 
374 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  36.24 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  32.68 
 
 
386 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  32.03 
 
 
382 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  29.24 
 
 
358 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  31.58 
 
 
377 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.76 
 
 
296 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  37.36 
 
 
303 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  37.36 
 
 
303 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  30.92 
 
 
376 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  35.38 
 
 
270 aa  55.1  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  24.85 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.98 
 
 
297 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  29.75 
 
 
389 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  30.92 
 
 
397 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  30.92 
 
 
397 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  32.51 
 
 
288 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  36.44 
 
 
486 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  28.07 
 
 
392 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  30.56 
 
 
274 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  34.68 
 
 
388 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.12 
 
 
299 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.11 
 
 
316 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  32.47 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  27.01 
 
 
289 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  37.01 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2243  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.75 
 
 
304 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.6 
 
 
340 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
327 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  30.68 
 
 
280 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  39.24 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  30.06 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  29.75 
 
 
380 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  31.33 
 
 
285 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
289 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  29.75 
 
 
380 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  30.92 
 
 
397 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.12 
 
 
285 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
367 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0866  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.18 
 
 
309 aa  52  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.55 
 
 
287 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  30.65 
 
 
403 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  35.16 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.09 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.8 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  33.78 
 
 
185 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0432  HemK family modification methylase  27.44 
 
 
282 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  27.46 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.4 
 
 
286 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  24.18 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119513  protein methyltransferase  28.12 
 
 
398 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2040  modification methylase, HemK family  31.62 
 
 
302 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  30.65 
 
 
287 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  29.73 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.43 
 
 
302 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0665  methyltransferase small  29.08 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  27.56 
 
 
409 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0447  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.44 
 
 
282 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  37.66 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1261  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
300 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0715503  normal  0.584452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>