More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0374 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  100 
 
 		 486 aa  960    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  46.96 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  48.05 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  47.36 
 
 		 498 aa  362  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  46.42 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  45.75 
 
 		 494 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  45.64 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  39.81 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  40.41 
 
 		 547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  40.64 
 
 		 549 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  39.47 
 
 		 549 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  42.45 
 
 		 509 aa  295  9e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  43.3 
 
 		 515 aa  289  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  41.55 
 
 		 508 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  41.6 
 
 		 522 aa  279  7e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  41.67 
 
 		 572 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  40.57 
 
 		 514 aa  262  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  38.87 
 
 		 498 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  38.91 
 
 		 502 aa  256  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  39.64 
 
 		 505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  38.16 
 
 		 494 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  39.56 
 
 		 507 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  39.56 
 
 		 507 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  40.49 
 
 		 508 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  38.74 
 
 		 507 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  43.9 
 
 		 498 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  37.5 
 
 		 558 aa  246  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  37.21 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  38.29 
 
 		 494 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  39.57 
 
 		 494 aa  223  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  34.37 
 
 		 481 aa  210  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  35.95 
 
 		 363 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  31.43 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  38.41 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  36 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  33.77 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  32.1 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  39.58 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  42.11 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  41.23 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.4 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  40.35 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  35.08 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.37 
 
 		 202 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  35.77 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  36.13 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.84 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  34.45 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03531  putative protein methyltransferase  34.04 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.854566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  36.03 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.6 
 
 		 284 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  39.68 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  32.18 
 
 		 198 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  36.89 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.02 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  33.83 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  35.48 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  42.45 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  43.21 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  28.23 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  30.88 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  32.47 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.71 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  29.79 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  36.29 
 
 		 294 aa  60.1  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  26.61 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  38.14 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  34.68 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  36.72 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  28.46 
 
 		 200 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.51 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  28.69 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.4 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  28.69 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.4 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  50 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.64 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  32.87 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  36.72 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.83 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  38.64 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  27.41 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  32.76 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1460  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.28 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  30.11 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.33 
 
 		 302 aa  57  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0498  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.24 
 
 		 298 aa  57  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  32.93 
 
 		 231 aa  57  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  26.5 
 
 		 278 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.08 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  31.14 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  31.47 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0447  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.97 
 
 		 282 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  33.6 
 
 		 284 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  31.25 
 
 		 324 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  31.25 
 
 		 233 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 		 280 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.85 
 
 		 275 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>