294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8445 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  100 
 
 
496 aa  990    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  50.2 
 
 
484 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  49.29 
 
 
494 aa  422  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  47.17 
 
 
480 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  47.47 
 
 
498 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  47.08 
 
 
490 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  46.96 
 
 
486 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  41.21 
 
 
494 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  42.52 
 
 
509 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  41.57 
 
 
494 aa  326  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  40.93 
 
 
549 aa  323  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  46.12 
 
 
515 aa  319  7e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  43.24 
 
 
572 aa  316  6e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  41.45 
 
 
514 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  40.4 
 
 
498 aa  310  5.9999999999999995e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  43.52 
 
 
508 aa  301  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  41.27 
 
 
507 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  41.27 
 
 
507 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  40.73 
 
 
502 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  40.87 
 
 
507 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  42.51 
 
 
522 aa  294  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  40.55 
 
 
505 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  39.48 
 
 
498 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  39.11 
 
 
536 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  42.26 
 
 
508 aa  280  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  38.13 
 
 
549 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  39.39 
 
 
547 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  38.22 
 
 
525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  35.7 
 
 
481 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  34.87 
 
 
494 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  35.78 
 
 
558 aa  213  7e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  30.3 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.59 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  29.92 
 
 
202 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  32.09 
 
 
281 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  31.02 
 
 
324 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  27.39 
 
 
202 aa  63.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.13 
 
 
202 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  32.93 
 
 
284 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  35.83 
 
 
270 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  24.39 
 
 
262 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.11 
 
 
281 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.08 
 
 
276 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  34.78 
 
 
340 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  29.22 
 
 
206 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.26 
 
 
286 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  42.31 
 
 
284 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  35.43 
 
 
285 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  33.33 
 
 
341 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  26.67 
 
 
208 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  31.67 
 
 
277 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  29.03 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.25 
 
 
285 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.75 
 
 
275 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  34.75 
 
 
274 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  29.41 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  33.6 
 
 
286 aa  58.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  40 
 
 
285 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 
276 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50510  predicted protein  24.91 
 
 
647 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  31.67 
 
 
277 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  32.2 
 
 
377 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  32.79 
 
 
283 aa  57.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  34.92 
 
 
284 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  33.85 
 
 
284 aa  56.6  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  30.95 
 
 
275 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.97 
 
 
286 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  26.19 
 
 
200 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.38 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  33.15 
 
 
341 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  29.87 
 
 
201 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  26.11 
 
 
202 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  32.56 
 
 
283 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  31.64 
 
 
397 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  33.06 
 
 
276 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  28.57 
 
 
317 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  40.79 
 
 
210 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.56 
 
 
281 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.06 
 
 
276 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  33.73 
 
 
286 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  27.2 
 
 
200 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  32 
 
 
307 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1540  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.31 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  39.19 
 
 
262 aa  54.3  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  31.44 
 
 
372 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  30.77 
 
 
317 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  34.11 
 
 
286 aa  53.5  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  31.25 
 
 
377 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  31.67 
 
 
276 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  25.73 
 
 
285 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  32.23 
 
 
276 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  39.47 
 
 
210 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  28.92 
 
 
317 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  24.35 
 
 
198 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.57 
 
 
276 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  31.39 
 
 
279 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  44.87 
 
 
255 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.43 
 
 
276 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  37.78 
 
 
275 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>