More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9295 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  100 
 
 
480 aa  941    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  68.38 
 
 
490 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  61.41 
 
 
494 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  59.63 
 
 
498 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  55.97 
 
 
484 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  46.95 
 
 
496 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  46.42 
 
 
486 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  45.28 
 
 
509 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  40.45 
 
 
549 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  42.6 
 
 
522 aa  295  9e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  41.54 
 
 
515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  40.91 
 
 
494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  37.76 
 
 
547 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  37.77 
 
 
536 aa  269  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  40.85 
 
 
498 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  41.41 
 
 
508 aa  266  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  41.61 
 
 
494 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  40.16 
 
 
572 aa  262  8e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  36.23 
 
 
549 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  43.93 
 
 
508 aa  259  6e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  39.59 
 
 
507 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  39.59 
 
 
507 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  39.34 
 
 
507 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  39.83 
 
 
502 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  40.65 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  40.26 
 
 
514 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  36.01 
 
 
481 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  40.34 
 
 
498 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  36.67 
 
 
558 aa  205  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  36.99 
 
 
494 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  35.69 
 
 
525 aa  199  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  38.89 
 
 
324 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  35.96 
 
 
341 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2567  methyltransferase small  41.96 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  34.27 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  34.88 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  46.59 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  34.27 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  37.5 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  36.15 
 
 
317 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  34.38 
 
 
317 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  32.71 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  33.9 
 
 
210 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  32.52 
 
 
281 aa  63.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  32.81 
 
 
317 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  38.46 
 
 
316 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  33.9 
 
 
210 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  33.83 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  33.76 
 
 
284 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.03 
 
 
276 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  38.02 
 
 
270 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.03 
 
 
276 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  33.33 
 
 
322 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  38.16 
 
 
359 aa  60.8  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  35.53 
 
 
200 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  44.68 
 
 
288 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  36.49 
 
 
200 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  34.38 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  36.49 
 
 
200 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  33.01 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  38.79 
 
 
286 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  35.16 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  36.36 
 
 
201 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  48.84 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  42.11 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  32.92 
 
 
285 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  39.81 
 
 
283 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.82 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  38.61 
 
 
204 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  36.29 
 
 
386 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.11 
 
 
285 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  34.12 
 
 
198 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  32.61 
 
 
316 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  43.42 
 
 
284 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  35.25 
 
 
274 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  42.67 
 
 
227 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.33 
 
 
276 aa  57  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.42 
 
 
276 aa  56.6  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.09 
 
 
281 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  30.1 
 
 
324 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.11 
 
 
275 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  41.11 
 
 
288 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  33.33 
 
 
206 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  30.43 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  38.46 
 
 
288 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3123  hypothetical protein  33.59 
 
 
318 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  41.03 
 
 
307 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  32.59 
 
 
211 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  32.18 
 
 
274 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  33.61 
 
 
279 aa  53.9  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0895  HemK family modification methylase  32.94 
 
 
258 aa  53.9  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00424484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.54 
 
 
276 aa  53.5  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.96 
 
 
367 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.43 
 
 
283 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  39.26 
 
 
286 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.36 
 
 
276 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.4 
 
 
285 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  33.6 
 
 
193 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  32.82 
 
 
256 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
275 aa  52.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>