More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2567 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2567  methyltransferase small  100 
 
 		 315 aa  607  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  71.01 
 
 		 324 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  70.53 
 
 		 340 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  71.43 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  70.85 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  52.79 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  53.33 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  52.29 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  52.07 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  52.46 
 
 		 317 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  51.8 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  53.11 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  52.79 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  51.91 
 
 		 316 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  51.97 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3123  hypothetical protein  52.22 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  49.77 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  41.96 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  32.91 
 
 		 490 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  34.86 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  34.86 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.26 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  31.51 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  38.17 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  35.98 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.13 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  34.48 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  37.58 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  37.95 
 
 		 514 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  28.08 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.87 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  35.09 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  36.9 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  33.09 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  44.25 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1870  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.61 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  34.08 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  32.41 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  38.99 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  36.36 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  34.3 
 
 		 486 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  37.11 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  29.29 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  33.33 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  31.72 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  39.55 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  39.55 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  36.42 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.85 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1415  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.270918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1480  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.760634  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  32.2 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  29.3 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  41.12 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.9 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1468  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  34.52 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3080  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  29.94 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  32.48 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3018  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.1 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  29.94 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  41.6 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  29.94 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.4 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  31.03 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  29.94 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  38.16 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  31.03 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  37.82 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  29.94 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4140  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.15 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.449195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.14 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  33.63 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  34.03 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  38.41 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  32.8 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  41.56 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2160  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.29 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  37.5 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.94 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  35.62 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  28.68 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  40.96 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  32.14 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  38.98 
 
 		 522 aa  63.2  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.03 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  33.63 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2770  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.46 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  36.99 
 
 		 525 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1606  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.46 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  0.243081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2847  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.46 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000091809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  35.26 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  26.98 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  30.81 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  36.73 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.01 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  41.6 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2977  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  39.08 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  33.19 
 
 		 507 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>