More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1985 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  100 
 
 		 514 aa  1004    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  68.73 
 
 		 505 aa  638    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  67.74 
 
 		 507 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  67.74 
 
 		 507 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  67.74 
 
 		 507 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  67.07 
 
 		 502 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  52.79 
 
 		 509 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  42.51 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  42.34 
 
 		 494 aa  329  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  41.45 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  44.26 
 
 		 498 aa  319  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  41.33 
 
 		 494 aa  302  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  40.36 
 
 		 522 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  40.57 
 
 		 486 aa  279  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  38.18 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  40.34 
 
 		 494 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  41.1 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  39.21 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  39.67 
 
 		 480 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  40.3 
 
 		 572 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  39.18 
 
 		 490 aa  253  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  39.26 
 
 		 508 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  38.75 
 
 		 481 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  35.17 
 
 		 536 aa  251  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  37.35 
 
 		 494 aa  249  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  41.56 
 
 		 498 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  38.63 
 
 		 549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  37 
 
 		 547 aa  240  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  37.68 
 
 		 508 aa  230  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  35.03 
 
 		 525 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  37.4 
 
 		 558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  33.33 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  30.92 
 
 		 363 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.09 
 
 		 286 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  31.9 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  33.33 
 
 		 210 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  36.42 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  33.84 
 
 		 324 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  43.31 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  41.22 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2567  methyltransferase small  38.1 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  33.33 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  34.87 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  32.89 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  37.82 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  42.52 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  39.36 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  36.31 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  33.51 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  39.1 
 
 		 274 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  36.89 
 
 		 236 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.24 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  41.18 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  33.33 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  35.9 
 
 		 281 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  26.38 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.61 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.61 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.61 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.61 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.61 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  35.11 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  35.44 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.46 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.79 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.61 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.61 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.61 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.61 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.61 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.09 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  33.61 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  35.48 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  30.89 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  38.64 
 
 		 275 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  31.67 
 
 		 341 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  37.9 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  31.37 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  30 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  39.52 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  32.3 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  33.33 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.42 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  27.04 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.61 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.1 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.77 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  46.15 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.77 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.77 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  31.11 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  29.17 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.66 
 
 		 347 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  32.56 
 
 		 198 aa  56.6  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  36.76 
 
 		 295 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  31.62 
 
 		 225 aa  56.6  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.5 
 
 		 280 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.07 
 
 		 299 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  33.82 
 
 		 284 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>