More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4693 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  77.51 
 
 
507 aa  726    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  100 
 
 
502 aa  991    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  77.51 
 
 
507 aa  726    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  85.32 
 
 
505 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  76.31 
 
 
507 aa  715    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  67.34 
 
 
514 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  52.77 
 
 
509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  43.7 
 
 
494 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  42.25 
 
 
498 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  43.65 
 
 
498 aa  316  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  43.09 
 
 
494 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  40.73 
 
 
496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  41.41 
 
 
515 aa  283  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  41.67 
 
 
494 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  40.36 
 
 
522 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  38.91 
 
 
486 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  38.59 
 
 
481 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  39.83 
 
 
480 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  36.13 
 
 
549 aa  263  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  40.88 
 
 
484 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  41.19 
 
 
572 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  36.2 
 
 
536 aa  260  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  41.04 
 
 
508 aa  257  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  41.37 
 
 
498 aa  252  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  38.15 
 
 
494 aa  252  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  40.04 
 
 
490 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  40.43 
 
 
508 aa  243  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  39.25 
 
 
547 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  39.76 
 
 
549 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  34.44 
 
 
525 aa  220  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  40.11 
 
 
558 aa  195  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  32.38 
 
 
363 aa  87  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  36.11 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  41.67 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  33.9 
 
 
206 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.46 
 
 
288 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  43.55 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  33.86 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  34.86 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.87 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.74 
 
 
286 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  31.62 
 
 
210 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  42.86 
 
 
274 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  32.57 
 
 
281 aa  63.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  29.91 
 
 
210 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.99 
 
 
275 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  41.03 
 
 
285 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.89 
 
 
284 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  34.56 
 
 
285 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.46 
 
 
202 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  37.84 
 
 
275 aa  61.2  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  35.03 
 
 
340 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  36.6 
 
 
286 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.78 
 
 
285 aa  60.1  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  46.15 
 
 
372 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  34.81 
 
 
317 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  44.74 
 
 
279 aa  59.3  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  35.65 
 
 
317 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  37.7 
 
 
295 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  33.76 
 
 
341 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  31.11 
 
 
201 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.57 
 
 
342 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  40 
 
 
284 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  34.88 
 
 
198 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.57 
 
 
342 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.57 
 
 
342 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  28.23 
 
 
208 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.57 
 
 
342 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.57 
 
 
342 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  27.41 
 
 
315 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  35.11 
 
 
198 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.1 
 
 
342 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  34.81 
 
 
341 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  34.15 
 
 
227 aa  57.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.4 
 
 
340 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  31.43 
 
 
283 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  34.13 
 
 
321 aa  57.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.12 
 
 
365 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  29.89 
 
 
202 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.57 
 
 
343 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.57 
 
 
343 aa  57  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.57 
 
 
343 aa  57  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  33.57 
 
 
343 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.57 
 
 
343 aa  57  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.57 
 
 
343 aa  57  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.1 
 
 
307 aa  57.4  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  27.91 
 
 
202 aa  57.4  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  30.08 
 
 
202 aa  57  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  34.12 
 
 
280 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  26.45 
 
 
200 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  27.64 
 
 
202 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.07 
 
 
330 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.18 
 
 
280 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  38.52 
 
 
276 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.26 
 
 
303 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  31.34 
 
 
280 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.04 
 
 
276 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.89 
 
 
276 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.87 
 
 
343 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  35.59 
 
 
289 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>