More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4180 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  77.6 
 
 		 494 aa  708    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  100 
 
 		 498 aa  975    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  59.63 
 
 		 480 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  57.55 
 
 		 490 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  56.06 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  47.47 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  47.36 
 
 		 486 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  40.07 
 
 		 549 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  42.54 
 
 		 522 aa  288  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  41.04 
 
 		 515 aa  286  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  42.74 
 
 		 508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  40.28 
 
 		 494 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  40.2 
 
 		 509 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  40.15 
 
 		 572 aa  277  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  37 
 
 		 536 aa  277  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  42.13 
 
 		 508 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  39.53 
 
 		 505 aa  263  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  37.9 
 
 		 547 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  40.45 
 
 		 494 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  37.83 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  41.88 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  42.51 
 
 		 498 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  41.04 
 
 		 514 aa  246  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  35.79 
 
 		 481 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  40.04 
 
 		 507 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  40.04 
 
 		 507 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  36.85 
 
 		 549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  40.3 
 
 		 507 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  36.35 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  39.45 
 
 		 558 aa  226  9e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  35.93 
 
 		 494 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  33.92 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  33.93 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  29 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  39.83 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  37.5 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  38.85 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  38.6 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  38.6 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.99 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  36.76 
 
 		 210 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  27.7 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.98 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.85 
 
 		 281 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.65 
 
 		 276 aa  67  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.11 
 
 		 276 aa  67  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  33.14 
 
 		 276 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  41.03 
 
 		 201 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.89 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  33.86 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  31.5 
 
 		 285 aa  66.6  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  39.83 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  30.06 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  32.57 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  30.46 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.71 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.57 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  35.2 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  35.48 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  32.11 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.85 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.41 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  36.49 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  30.67 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.66 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  33.75 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  35.38 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.33 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  39.17 
 
 		 204 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  38.16 
 
 		 200 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  39.19 
 
 		 200 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.74 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  39.19 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  33.62 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  37.8 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  30.89 
 
 		 363 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  34.68 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1540  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.56 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  37.31 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  35.04 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  33.33 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  41.18 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  22.73 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  40.5 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  29.5 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  33.33 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  35.2 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  26.09 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  33.59 
 
 		 286 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  25.9 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  33.57 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  42.5 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  31.67 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  34.15 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  36 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  36 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>