260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0053 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  828    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  93.32 
 
 		 404 aa  736    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  69.67 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  52.05 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  51.41 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  51.41 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  53.98 
 
 		 376 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  48.25 
 
 		 389 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  49.88 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  51.15 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  50.89 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  50.89 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  49.87 
 
 		 381 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  50.63 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  50.75 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  50.88 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  50.87 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  50.5 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  50.88 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  50.63 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  51.95 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  50.63 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  50 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  49.23 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  54.04 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  51.11 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  51.15 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  50.38 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  50 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  50.38 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  50.13 
 
 		 377 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  49.87 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  49.87 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  49.62 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  52.53 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  49.62 
 
 		 377 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  49.5 
 
 		 388 aa  338  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  47.52 
 
 		 358 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  47.49 
 
 		 425 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  42.86 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  41.27 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  41.54 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  40.7 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  40.66 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  57.83 
 
 		 89 aa  101  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.49 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  27.27 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  26.2 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  26.82 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  32.47 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  28.33 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  28.21 
 
 		 208 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  30.98 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  30.16 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.82 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  30.77 
 
 		 494 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  26.35 
 
 		 201 aa  57  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  36 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 288 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  31.75 
 
 		 185 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  24.65 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  23.49 
 
 		 199 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  26.35 
 
 		 317 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  26.06 
 
 		 199 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  26.06 
 
 		 199 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  30.41 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  30.82 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  40.91 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  26.06 
 
 		 199 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  29.41 
 
 		 177 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  26.06 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  26.06 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  26.06 
 
 		 199 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  33.77 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  26.06 
 
 		 199 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  25.33 
 
 		 199 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.53 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.28 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  35.53 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  25.33 
 
 		 199 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  28.76 
 
 		 185 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  34.31 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  32.46 
 
 		 536 aa  50.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  35.66 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  28.57 
 
 		 164 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  31.13 
 
 		 307 aa  50.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.1 
 
 		 276 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  30.22 
 
 		 278 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45 
 
 		 286 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  28 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  27.59 
 
 		 277 aa  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  34.82 
 
 		 285 aa  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.93 
 
 		 296 aa  49.7  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0498  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.37 
 
 		 298 aa  49.7  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  34.78 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  46.67 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01259  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.08 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  35.42 
 
 		 282 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>