More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2463 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  100 
 
 
340 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  96.47 
 
 
341 aa  647    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  85.16 
 
 
341 aa  564  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  67.83 
 
 
324 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2567  methyltransferase small  69.5 
 
 
315 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  52.47 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  51.63 
 
 
321 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  51.23 
 
 
317 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  52.9 
 
 
317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  53.21 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  52.2 
 
 
316 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  51.58 
 
 
317 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  50.46 
 
 
316 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  52.41 
 
 
315 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  50.34 
 
 
322 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3123  hypothetical protein  50.62 
 
 
318 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  48.48 
 
 
461 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  41.55 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  37 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  33.77 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  33.77 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.67 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  37.04 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1870  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.28 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  33.08 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1017  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.75 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  40.5 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  35.97 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1569  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.5 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  41.35 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  41.35 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0701  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2594  modification methylase, HemK family  31.48 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1322  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.03 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02255  N5-glutamine methyltransferase  36.03 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3471  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.03 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02215  hypothetical protein  36.03 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  34.27 
 
 
480 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2625  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.03 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  41.49 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2467  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.3 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.466168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1415  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.81 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.270918  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1480  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.81 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.760634  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  39.26 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1468  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.81 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  42.16 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  36.69 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  31.79 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  35.4 
 
 
199 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1326  modification methylase, HemK family  35.29 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.695473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2487  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.29 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0920216  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3080  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.14 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  35.4 
 
 
199 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2708  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.29 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2482  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.29 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.26 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.39 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  32.26 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  35.4 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  35.4 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  35.4 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  35.4 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  34.64 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  35.4 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  35.79 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  35.98 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  34.84 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.95 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.33 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  39.33 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  31.72 
 
 
484 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1700  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.62 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1344  modification methylase, HemK family  32.53 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  33.75 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  40 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  30 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  35.96 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  40.54 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  37.42 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.61 
 
 
277 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  31.61 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  40.74 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.61 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  38.33 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.61 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.61 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.61 
 
 
277 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  51.32 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  35.4 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  34.51 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.61 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  35.64 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  35.43 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02756  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.52 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0268586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  36.89 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.66 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  36.54 
 
 
285 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  36.84 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.51 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>